Μετά από μία ποδοσφαιρική σεζόν απουσίας από τις ευρωπαϊκές
διοργανώσεις, ο Παναθηναϊκός όχι απλά επιστρέφει αλλά το πετυχαίνει με
τη συμμετοχή του στον γ' προκριματικό γύρο του Champions League. Η
τελευταία φορά που αγωνίστηκε στο συγκεκριμένο θεσμό δεν
απέχει πολύ χρονικά, αφού σημειώθηκε το καλοκαίρι του 2012. Τότε, πάλι
έχοντας τερματίσει στην πρώτη θέση των play off τη σεζόν 2011-2012, πήρε
μέρος στον γ' προκριματικό γύρο. Στο πρώτο παιχνίδι της Σκωτίας
επικράτησε 0-2 και στη ρεβάνς του "Σπύρος Λούης" νίκησε 3-0,
πανηγυρίζοντας την πρόκριση στα play off. Απέναντι στη Μάλαγα δεν
κατάφερε να καλύψει τη διαφορά δυναμικότητας και με ήττα 2-0 στην
Ισπανία και με ισοπαλία 0-0 στην Αθήνα, έμεινε εκτός από τους ομίλους. Ωστόσο,
η ευρωπαϊκή περιπέτεια του συνεχίστηκε και έληξε στους ομίλους του
Europa League, όπου με απολογισμό 5 βαθμούς (1 νίκη, 2
ισοπαλίες και 3 εκτός έδρας ήττες), τερμάτισε στην 3η θέση. Τη
σεζόν 2013 - 2014 ο Παναθηναϊκός δεν αγωνίστηκε στις διοργανώσεις της
UEFA, αφού αρχικά δεν κέρδισε την έξοδο του μέσω του πρωταθλήματος, ενώ
όταν δεν αδειοδοτήθηκε ο προηγούμενος στη βαθμολογία ΠΑΣ Γιάννενα, ούτε
αυτός κατάφερε να πάρει την άδεια...Όσον
αφορά τη συμμετοχή του Παναθηναϊκού στον γ' προκριματικό γύρο του
Champions League, δεν είναι σίγουρη η παρουσία του
στο γκρουπ των ισχυρών ή των αδύνατων. Για να βρεθεί στους πρώτους,
θέλει 4 ομάδες (αφού θα υπάρχει κι η Φέγενορντ) εκ των Λοκομοτίβ Μόσχας,
Σεντ Ετιέν, Ζούλτε Βάρεγκεμ, Γκράσχοπερ, ΑΕΛ, Απόλλων Λεμεσού και
Μίντιλαντ να βρεθούν στην ίδια κληρωτίδα μαζί του.